O Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (Mapa) e as Agências de Defesa Agropecuária nos estados realizam, por ano, cerca de 40 mil fiscalizações de agrotóxicos. Em 2009, foram registradas 17.962 ações sobre o uso de agrotóxicos e 19.507 vistorias em canais de distribuição. Nesse período, mais de um milhão de toneladas de produtos foram inspecionados, envolvendo o trabalho de 2.268 profissionais.
A fiscalização verifica se o produto está sendo utilizado na cultura indicada, o local de estocagem, se o agricultor usou receituário agronômico na compra e se o aplicador tem Equipamento de Proteção Individual (EPI).